SPF鸡胚中内源性白血病病毒全基因序列鉴定与分析

• 作者: 姜世金 孔义波 孙亚妮 张兴晓 赵钦
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 农学
• 关键词: 内源性白血病病毒 全基因组核苷酸序列 同源性分析
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 53-58
• 页数: 6页
• 分类号: S852
• 字数: 3728字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-8721.2008.01.009

摘要

摘要:以国内某3家SPF鸡场的SPF鸡胚成纤维细胞提取的基因组DNA为模板,参照已发表的序列,设计合成了4对检测内源性白血病病毒引物,分别检测gag基因、pol基因、env基因和LTR片段,结果显示4者检出阳性率很高(gag,29/46;pol,27/46;env,24/46;LTR,31/46).设计合成了8对引物,选取4片段检测均为阳性的样品之一,经PCR成功扩增出了8段连续的、相互部分重叠的目的DNA片段,分别连接入T载体进行克隆测序.用DNAstar软件对测序结果进行拼接,从一个鸡胚得到了内源性白血病病毒前病毒全基因组序列.比较分析发现,该序列env基因与已知的E亚群内源性病毒代表株env基因的核苷酸序列同源性在98.5%以上,全基因组序列同源性在99.1%以上,而与其他亚群代表株同源性相对较低,env基因同源性仅为56.3%～91.5%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姜世金	山东农业大学动物医学院	90	1341	19.0	33.0
2	赵钦	山东农业大学动物医学院	6	31	3.0	5.0
3	张兴晓	山东农业大学动物医学院	19	133	7.0	11.0
5	孔义波	山东农业大学动物医学院	8	78	5.0	8.0
6	孙亚妮	山东农业大学动物医学院	5	49	3.0	5.0