金沙江干热河谷区胡枝子(Lespedeza Michx)根瘤菌多样性及其系统发育

• 作者: K.Lindstrom 张小平 彭贤超 徐开未 黄昌学
• 来源期刊: 生态学报
• 关键词: 数值分类 BOXAIR-PCR 16S rDNA PCR-RFLP GSⅡ基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2008,（11）
• 页码范围: 5469-5481
• 页数: 13页
• 分类号: Q143
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-0933.2008.11.031

摘要

研究利用数值分类、BOXAIR-PCR指纹图谱、16S rDNA PCR-RFLP、16S rDNA和GSⅡ序列分析等方法,研究了分离自金沙江干热河谷区的86株胡枝子根瘤菌的多样性和系统发育,结果表明金沙江干热河谷区胡枝子根瘤菌蕴涵丰富的生物多样性.通过数值分类,供试未知菌株表现出极大的表型性状多样性,能耐高温(60 ℃)和低pH (4.0),在低温(10 ℃)或者高pH (9.0)条件下生长很差,耐盐性也很差.供试未知菌株的16S rDNA用HaeⅢ、MspⅠ、HinfⅠ和TaqⅠ酶切后具有16种遗传图谱类型,其中10株供试未知菌的16S rDNA遗传图谱类型不同于所选用的已知参比菌株.BOXAIR-PCR的分群结果分散,很多在16S rDNA PCR-RFLP中具有相同遗传类型的菌株也表现较大差异,表明了供试菌株在基因组水平上差异很大.序列分析结果表明,6株代表菌株分布于Rhizobium、Sinorhizobium、Mesorhizobium、Bradyrhizobium 4个属,16S rDNA序列与GSⅡ序列分别构建的系统发育树在属水平上基本一致,但16S rDNA序列的同源性比GSⅡ高,6株代表菌株间16S rDNA序列的同源性在87.5%～99.5%之间,GSⅡ序列的同源性在79.4%～89.8%之间;而代表菌株与亲缘关系最近的参比菌株间的16S rDNA序列的同源性为99.9%～100%,GSⅡ的同源性为88.9%～99.6%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张小平	四川农业大学资源环境学院	137	2144	25.0	38.0
2	徐开未	四川农业大学资源环境学院	39	432	11.0	18.0
3	彭贤超	四川农业大学资源环境学院	2	19	2.0	2.0
4	黄昌学	四川农业大学资源环境学院	2	19	2.0	2.0