快速诊断性DNA测序法鉴定致病性猪链球菌

• 作者: 刘美真 朱振宇 杨杏芬 柯昌文 柯碧霞 王洪敏 邓小玲 陈经雕
• 来源期刊: 华南预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 多聚酶链反应 DNA测序 猪链球菌
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 13-17
• 页数: 5页
• 分类号: R378.12
• 字数: 4714字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-5039.2008.01.004

摘要

目的 尝试将诊断性DNA测序方法优化后用于猪链球菌的快速鉴定.方法 5个来源于临床感染病例的可疑猪链球菌分离株,用诊断性PCR产物直接测序法分析其基因组上的16S rRNA,cps2J和mrp 3个特征性靶基因的DNA序列;并对整个技术流程进行优化改进,缩短获得结果的时间.结果 获得了5个可疑猪链球菌菌株的3个靶基因片段的DNA碱基序列;这5个菌株被扩增检测的基因区域,有相同的16S rRNS、cps2J和mrp基因片段,长度分别为336、437、520bp;将这3个靶基因片段序列上栽到NCBI-BLAsT服务器,与GenBank核酸序列数据库的已知序列进行比对分析,结果显示,该5个可疑茵株的被分析的3个靶基因片段与猪链球菌2型的同源性最高.优化后的方法在得到经过适当培养的纯茵后,在不超过7～8 h内,就可以获得靶基因片段的DNA测序结果.结论 该5个来源于临床感染病例的可疑茵株为血清2型猪链球菌;经优化改进的诊断性DNA测序方法可用于猪链球菌的快速鉴定.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨杏芬	广东省疾病预防控制中心中山大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室	153	947	14.0	22.0
2	柯昌文		154	1211	18.0	26.0
3	陈经雕		34	211	10.0	13.0
4	朱振宇	中山大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室	51	397	8.0	18.0
5	邓小玲		59	426	13.0	18.0
6	柯碧霞		53	276	10.0	13.0
7	刘美真		42	284	11.0	15.0
8	王洪敏	中山大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室	1	3	1.0	1.0