Barrett食管基因差异表达谱初步探讨

• 作者: 孙永刚 徐梅 徐江涛 房殿春 杨仕明 汪兴伟 郜恒骏
• 来源期刊: 胃肠病学
• 学科: 医学
• 关键词: Barrett食管 微阵列分析 差异表达 基因表达谱
• 年，卷（期）: 2008,（10）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 603-606
• 页数: 4页
• 分类号: R5
• 字数: 3428字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-7125.2008.10.008

摘要

背景:病变组织差异表达基因的分析有助于寻找与疾病发生、发展和临床治疗有关的关键分子.目的:应用寡核苷酸芯片对Barrett食管与正常食管黏膜组织的差异表达基因进行高通量分析,以期筛选与Barrett食管发生、发展相关的分子标记物.方法:取6例Barrett食管患者病变食管黏膜和相应正常食管黏膜组织,Trizol一步法抽提总RNA,纯化后合成cRNA探针:探针荧光标记和纯化后.将两种组织探针分别与Agilent全基因组寡核苷酸芯片(含30 968个基因组探针)进行杂交;获取芯片扫描图谱,以特征提取软件行定量分析、处理.结果:Barrett食管与正常食管黏膜组织的2倍差异表达(Ratio值≥2或≤0.5)基因中,上调基因142个,下调基因284个,涉及细胞周期相关基因、信号转导相关基因、黏蛋白相关基因、癌基因和抑癌基因、骨形态蛋白基因、凋亡抑制基因、bcl-2家族相关基凶等.结论:高通量的基因芯片技术可筛选出大量Barrett食管相关基因,对这些相关基因的功能进行验证将有助于找到Barrett食管发生、发展的关键基因或通路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	房殿春	第三军医大学西南医院全军消化病研究所	349	2116	20.0	30.0
2	杨仕明	第三军医大学西南医院全军消化病研究所	97	741	14.0	20.0
3	汪兴伟	第三军医大学西南医院全军消化病研究所	29	291	7.0	16.0
4	徐梅	第三军医大学西南医院全军消化病研究所	12	59	3.0	7.0
5	郜恒骏	第三军医大学西南医院生物芯片上海国家工程研究中心	1	5	1.0	1.0
9	徐江涛	第三军医大学西南医院生物芯片上海国家工程研究中心	1	5	1.0	1.0