一株新城疫病毒分离株全基因组序列的克隆与分析

• 作者: 刘宇卓 张敬峰 李银 魏雪涛
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 新城疫病毒 全基因组 测序与分析
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 页码范围: 159-163
• 页数: 5页
• 分类号: S858.31
• 字数: 3120字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2008.02.010

摘要

根据GenBank上所公布的新城疫病毒(NDV)的全基因组序列,设计了10对引物,运用RT-PCR方法获取了三黄鸡新城疫病毒(SHJ00株)全基因组序列,并对其进行了比较分析.结果表明:此株三黄鸡新城疫病毒(SHJ00)的全基因组序列由15 192个碱基组成,在NP基因和P基因之间的非翻译区多了6个核苷酸ACACTC;与NDV一致,SHJ00基因由6个ORF组成,即3'-NP-P-M-F-HN-L-5';测序后拼接的F基因长1 672 bp,包含完整的开放阅读框(1 662 bp),编码553个氨基酸,F蛋白裂解位点的氨基酸顺序为112R-R-Q-K-R-F117,具有强毒株序列特性;根据NDV基因分型标准,三黄鸡新城疫病毒SHJ00株归属基因Ⅶ型新城疫病毒;F基因与国内外 NDV代表株的核苷酸同源性为 80.9%～97.7%,其中与F48E9同源性为84.3%,与 Lasota的同源性为 82.0%;测序后拼接的HN基因长为1 716 bp,编码571个氨基酸,与国内外 NDV 代表株的核苷酸同源性为 80.0%～98.1%,其中与F48E9同源性为84.5%,与 Lasota的同源性为81.4%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	魏雪涛	江苏省农业科学院兽医研究所	9	38	3.0	6.0
2	李银	江苏省农业科学院兽医研究所	34	297	10.0	15.0
3	刘宇卓	江苏省农业科学院兽医研究所	26	134	6.0	11.0
4	张敬峰	江苏省农业科学院兽医研究所	36	148	6.0	11.0