油菜沪油15中AP2/ERF-B3亚族转录因子的克隆和生物信息学分析

• 作者: 乔玉山 周熙荣 姚泉洪 孙超才 庄静 彭日荷 熊爱生 章镇 管帮超
• 来源期刊: 分子细胞生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 转录因子 AP2/RFF-B3亚族 生物信息学 进化树 油菜沪油15
• 年，卷（期）: 2008,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 192-206
• 页数: 15页
• 分类号: Q94
• 字数: 8182字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1673-520X.2008.03.004

摘要

AP2/ERF转录因子家族广泛存在于植物中,参与植物细胞周期、生长发育以及生物和非晌镄财认喙鼗虮泶锏骺?本文利用油菜UniGene数据库.以拟南芥AP2/ERF-B3亚族转录因子保守序列为信息探针,分离得到2个油菜AP2/ERF-B3亚族的转录因子BnaERFB3-1和BnaERFB3-2.通过PCR和RT-PCR方法分别从双低甘蓝型油菜沪油15的DNA和cDNA中克隆了上述基因.序列分析显示.克隆的BnaERFB3-1-Hv15和BnaERFB3-2-Hv15转录因子与电子克隆的基因序列差异很小,均只有1个氨基酸位点不同.且都没有内舍子.从氨基酸序列的相似性、组成成分、理化性质、疏水性/亲水性、序列比对、进化树、功能域、二级结构、三级结构、无序化特性等方面进行了预测和较为全面的分析.结果显示BnaERFB3-1-Hv15和BnaERFB3-2-Hv15是亲水性蛋白,在蛋白质的三级结构上与AtERF5相似,BnaERFB3-1-Hv15和BnaERFB3-2-Hv15蛋白无序化程度大于拟南芥AtERF5.通过分析EST丰度显示,BnaERFB3-1的表达集中在种子中,而BnaERFB3-2的表达则集中在根中.另外.将上述基因分别构建入酵母表达载体和植物双元表达载体,为深入研究该基因在油菜抗逆调控中的作用奠定了基础.