PCR-RFLP技术分析沼气池厌氧活性污泥细菌的多样性

• 作者: 周权能 武波 蒋建林 车志群 邓珍琴
• 来源期刊: 广西农业生物科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 沼气池 16SrDNA PCR-RFLP 细菌多样性
• 年，卷（期）: 2008,（4）
• 所属期刊栏目: 生物技术专栏
• 页码范围: 372-377
• 页数: 6页
• 分类号: Q938.1
• 字数: 3948字
• 语种: 中文

摘要

应用PCR-RFLP和rRNA分析法研究了户用沼气池厌氧活性污泥细菌的多样性.采用直接提取法提取了户用沼气池微生物宏基因组DNA,构建了细菌的l6S rDNA克隆文库.随机挑取了144个准确含有16S rDNA的阳性克隆进行PCR-RFLP分析,聚类得到46个OTUs(operational taxonomic units),其中3个OTUs是优势类群,分别占14%,10%和9%,21个OTUs只含有单个克隆.随机挑取了26个克隆进行测序,并构建了系统发育进化树.结果表明:农村户用沼气池中细菌种类较为丰富,占优势的类群分别为Firmicutes(28%)、Delta-proteobacteria(18%)和Bacteroidetes(17%),大多数16S rDNA序列与GenBank数据库中未培养细菌相似性最高(91%～99%),为进一步研究、利用沼气池能源提供了基础资料.