基于Linux+Apache+MySQL+PHP的棉花分子生物学数据库系统构建

• 作者: 张桂寅 张荣志 王省芬 迟吉娜 马峙英
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 棉花 分子生物学数据库 wwwBLAST本地化 生物信息学
• 年，卷（期）: 2008,（5）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 399-封3
• 页数: 3页
• 分类号: S562.035.3
• 字数: 1729字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-7807.2008.05.015

摘要

利用课题组积累的数据信息和网上公用数据库中有关棉花分子生物学数据,采用MySQL为后台数据库,以Apache+PHP为环境,在Linux操作系统下实现了棉花分子生物学数据库系统的构建和wwwBLAST的本地化服务.在脱机状态下使用blast进行同源性比对,使得数据查询和序列比对更加方便、快捷、稳定和安全,而且增强了针对性.数据库最终以局域网的形式发布,通过授予权限可向同行提供利用.本课题组在棉纤维品质、黄萎病抗性等相关基因的克隆研究中使该数据库得到初步应用.