草鱼种质相关SRAP及SCAR的分子标记

• 作者: 丁炜东 曹丽萍 曹哲明
• 来源期刊: 动物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 草鱼 种质退化 SRAP分子标记 SCAR标记
• 年，卷（期）: 2008,（3）
• 所属期刊栏目: 生理学和生物化学、细胞生物学及发育生物学、遗传学与分子生物学
• 页码范围: 475-481
• 页数: 7页
• 分类号: Q95
• 字数: 5696字
• 语种: 中文

摘要

采用相关序列扩增多态性(Sequence-realted Amplified Polymorphism, SRAP)技术分析野生草鱼和家养草鱼,筛选与草鱼种质退化相关的分子遗传标记.共进行88对引物组合的检测, 产生标记数目共计905个.依据标记在群体中出现的频率和变化规律,共筛选出2 1个可能与种质相关的特异性标记,对这些特异性标记进行测序并将测序结果进行BLAST分析 .发现测得片段中有8个片段在GenBank中找到同源性较高的序列,而其他片段与数据库中序列的相似性较低.根据序列信息分别设计了3对引物.用这3对引物分别对草鱼三个群体进行 PCR扩增,分别产生了SCAR1(308 bp)、SCAR2(66 bp)、SCAR3(114 bp)3个扩增带.采用大样本对这3个标记进行验证,发现其中SCAR1在家养群体中呈现阳性,在野生群体中为阴性,可区分出这两种群体.以SCAR3为引物在174条家养群体中得到目的片段,在26个家养群体没有扩增出条带,分布频率为87%;在100个野生群体中有6个个体检测到该条带,分布频率为6%.以SCAR2为引物在野生群体中完全扩增出目的条带,淡水中心群体中有7条扩增到条带,前洲群体中没有扩增出条带,标记在家养种群中的分布频率为96.50%.因此SCAR1可作为草鱼家养群体的一个重要的分子遗传特征指标,为进一步进行分子标记辅助育种奠定了基础 [动物学报 54(3):475-481,2008].

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	丁炜东	中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部水生动物遗传育种和养殖生物学重点开放实验室	33	330	10.0	17.0
2	曹丽萍	中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部水生动物遗传育种和养殖生物学重点开放实验室	29	389	11.0	19.0
3	曹哲明	中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部水生动物遗传育种和养殖生物学重点开放实验室	23	427	9.0	20.0