基于SAFLP的我国常见索线虫科昆虫病原线虫亲缘关系分析

• 作者: 姜爱兰 王国秀 贺俊飞 饶祥军
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 昆虫病原线虫 索线虫科 SAFLP 聚类图 亲缘关系 中国
• 年，卷（期）: 2008,（9）
• 所属期刊栏目: 病理
• 页码范围: 924-929
• 页数: 6页
• 分类号: Q959|Q75
• 字数: 5302字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0454-6296.2008.09.005

摘要

本研究建立并优化了索线虫科(Mermithidae)SAFLP体系,构建了我国常见索线虫科昆虫病原线虫6属11种/亚种的指纹图谱.采用EcoRⅠ和MseⅠ两种限制性内切酶单酶切,结果显示EcoRⅠ酶更适合作为索线虫科线虫SAFLP的内切酶.3个带有3个选择性碱基的EcoRⅠ引物进行扩增共得条带225个,片段大小为250～1 650 bp.通过NTsys-PC2.1软件计算了索线虫科6属11种/亚种的Nei-Li遗传距离(0.1980～0.4554)和相似系数,利用NTsys-PC2.1软件中的UPGMA方法构建其聚类图.索线虫科这6属11种/亚种从属级阶元可以分为两大类群:罗索属Romanomermis和八腱索属Octomyomermis聚为一支构成第一大类群;六索属Hexamermis与卵索属Ovomermis先聚在一起然后与多索属Agamermis聚在一起,再与两索属Amphimermis聚在一起构成第二大类群.在八腱索属和两索属中属内不同种/亚种间线虫采集地相距较近的其遗传距离较近.优化的索线虫科线虫SAFLP体系能够反映索线虫科线虫种属间的亲缘关系,并与形态学的研究结果基本相符,可以用于属种的分类和亲缘关系的研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王国秀	华中师范大学生命科学学院	54	580	14.0	21.0
2	姜爱兰	华中师范大学生命科学学院	5	47	3.0	5.0
3	饶祥军	华中师范大学生命科学学院	2	11	2.0	2.0
4	贺俊飞	华中师范大学生命科学学院	3	20	2.0	3.0