基于Petri网的基因调控网络建模与分析

• 作者: 孟春 郭红 黄佳良
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 学科: 工学
• 关键词: 混合函数Petri网 基因调控网络 海胆endo16基因 协同作用 逻辑规则
• 年，卷（期）: 2008,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 418-423
• 页数: 6页
• 分类号: Q811.4|TP391.9
• 字数: 5066字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-3282.2008.04.009

摘要

如何有效描述与分析复杂的基因调控网络(GRN)是生物学家研究基因表达调控机制的关键步骤.现有大部分方法在建模过程中忽略了生物中广泛存在的协同作用,模型预测结果与实际生物行为之间存在误差.基于混合函数Petri网(HFPN)理论提出了一种对基因调控网络进行定量分析的新方法.首先简要介绍GRN与HFPN的基础理论,然后为HFPN引入两类新元素:逻辑库所与逻辑变迁,描述基因调控网络的逻辑规则以及转录因子间的协同作用,最后构建海胆endo16基因调控网络的Petri网模型,并预测模型在不同位点发生突变时的基因表达水平变化.分析结果与文献实验数据相一致,验证了方法的正确性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孟春	福州大学生物科学与工程学院	89	1047	15.0	29.0
2	郭红	福州大学数学与计算机科学学院	44	244	8.0	14.0
3	黄佳良	福州大学数学与计算机科学学院	3	15	2.0	3.0