样本容量对养殖群体内主要遗传结构分析参数的影响

• 作者: 于东梅 孙效文 朱晓东 李大宇 杨建新 金万昆 马海涛 鲁翠云
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 样本容量 养殖群体 遗传结构 参数
• 年，卷（期）: 2008,（5）
• 页码范围: 674-683
• 页数: 10页
• 分类号: S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-0615.2008.05.003

摘要

用微卫星标记评估养殖群体的遗传结构,设置8个取样量梯度,5个标记量梯度,统计分析了各遗传参数的变化.结果:群体等位基因数(A)随样本量的增加而呈现上升趋势,但上升幅度由0.6667～0.9615(10<n<30)下降到0.2308～0.3333(30<n<50);46.15%的位点出现高频率等位基因即等位基因纯合化趋势,这可能与养殖群体长期受选择压力的影响有关.等位基因纯合化使多数位点的有效等位基因数(Ae)、期望杂合度(Ho)及多态信息含量(PIC)在样本量大于40时,在多个标记量梯度其变动范围均变小,并出现平台现象.样本量、微卫星标记的数量和多态性水平对群体遗传结构均有较大的影响,建议在用微卫星进行群体遗传评估时,标记的数量在20个以上,样本容量大小在40～50之间较为适合.