沙眼衣原体多形态膜蛋白D基因序列分析及其B细胞抗原表位预测

• 作者: 刘光桥 宋立华 端青 邱少富
• 来源期刊: 微生物学免疫学进展
• 学科: 医学
• 关键词: 沙眼衣原体 多形态膜蛋白D 二级结构 B细胞表位 预测
• 年，卷（期）: 2008,（3）
• 所属期刊栏目: 衣原体
• 页码范围: 24-28
• 页数: 5页
• 分类号: R374+.1
• 字数: 2760字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-5673.2008.03.006

摘要

分析沙眼衣原体多形态膜蛋白D(PmpD)的基因序列并预测PmpD蛋白的B细胞抗原表位.在GenBank中检索沙眼衣原体不同血清型的PmpD基因序列,进行序列比对分析.以L2血清型PmpD基因序列为材料,采用Karplus-Schulz、Chou-Fasman和Gamier-Robson方案预测蛋白质的二级结构和柔性区;按Jamesonv-Wolf方案预测抗原指数,运用Kyte-Doolittle方案预测PmpD氨基酸的亲水性,利用Emini方案预测蛋白质的表面可及性.检索到20个沙眼衣原体不同菌株的PmpD基因序列,分析发现其核苷酸序列非常保守,一致性高达99.14%～100%;对预测结果综合分析,推测最有可能的B细胞表位位于PmpD N端的67～74、132～140、335～340、851～861、972～988及1091～1097.多参数方案综合预测PmpD蛋白的B细胞抗原表位,为进一步实验鉴定PmpD抗原表位及其多表位疫苗设计和研究奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	端青	军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室	66	389	9.0	15.0
2	宋立华	军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室	12	66	5.0	7.0
3	刘光桥	军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室	4	10	2.0	3.0
4	邱少富	军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室	19	148	7.0	11.0