东北太平洋深海沉积物细菌多样性

• 作者: 吴敏 徐宏翔 杨俊毅 王小谷 王春生
• 来源期刊: 生态学报
• 关键词: 多金属结核合同区 深海沉积物 细菌多样性 16S rRNA
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 页码范围: 479-485
• 页数: 7页
• 分类号: Q16|Q178|Q938
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-0933.2008.02.004

摘要

采用两种方法提取中国结核合同区东区沉积物不同层次总DNA,通过克隆测序构建了含有79个克隆子的细菌16S rRNA基因文库,分析了该海域沉积物中细菌的多样性.79个克隆在系统发育树中形成了11个大分支,包括Gamma proteobacteria(22.8%),Alpha proteobacteria(16.5%),Planctomycetacia(7.6%),Delta proteobacteria(6.3%), Nitrospira(6.3%),Actinobacteria(6.3%),Beta proteobacteria(5%),Acidobacteria(5.1%),Sphingobacteria(3.8%),Firmicutes(2.5%),Other bacteria(17.7%),其中Gamma proteobacteria在总文库中所占比例最高,该分支细菌在0～2cm、4～6cm层也是优势菌种.Gamma proteobacteria中假单胞菌(Pseudomonas)为优势属(22.2%).各个层次中所含细菌类群有所不同,Alpha proteobacteria、Gamma proteobacteria、Delta proteobacteria 、Planctomycetacia、Nitrospira 、Actinobacteria和Acidobacteria为三层样品共有类群.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴敏		86	737	15.0	24.0