嗜酸氧化亚铁硫杆菌基因组分泌蛋白的初步分析

• 作者: 曾嘉 柳建设 赵文杰 邱冠周
• 来源期刊: 现代生物医学进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 嗜酸氧化亚铁硫杆菌 信号肽 分泌蛋白
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 22-26
• 页数: 5页
• 分类号: Q933
• 字数: 4331字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-6273.2008.01.008

摘要

利用信号肽预测软件SignalP v3.0、跨膜螺旋结构预测软件TMHMM v2.0和非经典分泌蛋白预测软件SecretomeP对嗜酸氧化亚铁硫杆菌全基因组的3 218个氨基酸序列进行预测分析.结果表明在嗜酸氧化亚铁硫杆菌中有507个蛋白为分泌蛋白,其中分泌型信号肽120个(其中有9个为RR-motif亚组型信号肽),脂蛋白信号肽3个,Prepilin-like信号肽4个,非经典分泌蛋白380个.并对分泌型信号肽的长度分布、氨基酸使用频率和酶切位点的氨基酸使用频率作了统计.得分最高的100个非经典分泌蛋白中,有36个具有功能分类,主要是参与细胞壁、能量代谢及转运和结合的蛋白质.嗜酸氧化亚铁硫杆菌的这507个分泌蛋白所参与的生化过程可能发生在膜外的周质空间或是菌体外的场所,为该物种与矿物相互作用,以及对环境做出响应服务.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邱冠周	中南大学资源加工与生物工程学院	335	5466	36.0	53.0
2	柳建设	中南大学资源加工与生物工程学院	48	520	14.0	20.0
3	曾嘉	中南大学资源加工与生物工程学院	4	30	2.0	4.0
4	赵文杰	中南大学资源加工与生物工程学院	1	7	1.0	1.0