鲤外周血白细胞蛋白酶体激活因子PA28β全长cDNA的克隆、鉴定及其差异表达分析

• 作者: 付保忠 刘相叶 卢强 孙晓义 李伟 谭业平 邓洪宽
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鲤 PA28β cDNA克隆 鉴定 差异表达分析
• 年，卷（期）: 2008,（6）
• 页码范围: 831-837
• 页数: 7页
• 分类号: Q785|S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-0615.2008.06.003

摘要

采用基因文库筛选方法,克隆了鲤外周血白细胞蛋白酶体激活因子PA28βcDNA,对其序列进行了分析,同时利用半定量反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法检测了不同外界因子刺激下鲤外周血白细胞PA28β的表达情况.结果显示,用DD-RTPCR的方法获得差异显示片段A18,经地高辛标记作为探针对有丝分裂原刺激的鲤外周血白细胞cDNA文库进行核酸杂交筛选,从0.8×104个重组噬菌体中,经过两轮筛选获得阳性克隆.序列分析表明,该阳性克隆长1175bp,含有一个大小为735bp编码244个氨基酸的完整开放阅读框,为编码鲤鱼蛋白酶体激活因子PA28β的全长cDNA.系统发生分析其与已报道的斑马鱼蛋白酶体激活因子PA28β亲缘关系最近,基因序列的同源性达95%.分离培养鲤外周血白细胞,在不同条件下经PHA和ConA刺激后,利用Trizol提取总RNA,根据得到的PA28β全长cDNA序列和鲤鱼β-actin序列设计引物,利用RT-PCR方法对鲤外周血白细胞PA28β进行差异表达分析,结果表明:经有丝分裂原刺激后前期(4h)白细胞中PA28β的表达量明显增大,但随着时间推移(12h、24h)表达增加量有所降低,并不随时间的延长而持续增加.在刺激的和正常的白细胞中PA28β表达趋势都成抛物线图,不同的是经刺激的比正常的PA28β的表达量提前达到峰值.首次报道鲤蛋白酶体激活因子PA28β的全长cDNA序列,鲤PA28β的cDNA序列GenBank注册号为EU255233,并对其进行差异表达分析,这些结果可为PA28β在鱼类免疫应答中的作用研究提供参考和依据.