结缕草属植物SRAP-PCR体系的建立和优化

• 作者: 刘建秀 王志勇 薛丹丹 郑轶琦 郭海林 陈宣
• 来源期刊: 草业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 结缕草属植物 SRAP标记 单因子试验 正交设计 体系优化
• 年，卷（期）: 2008,（6）
• 页码范围: 93-101
• 页数: 9页
• 分类号: S543+.901|Q946-33
• 字数: 5583字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1004-5759.2008.06.014

摘要

以SDS法提取的结缕草属植物叶片DNA为模板,分别采用单因子试验和正交设计试验2种方法,对影响结缕草属植物SRAP-PCR的Mg2+、dNTP、引物、Taq DNA聚合酶和模板DNA五个因素进行优化试验.单因子试验分别研究各因素在多水平条件下对SRAP-PCR反应体系的影响,得到最佳反应条件.正交设计采用L16(45)方案,综合考虑各因素间的相互作用,通过直观分析法获得各影响因素的最佳反应水平.根据4对引物对6份结缕草属植物材料扩增结果的验证比较,2种方法所获得的最佳反应体系存在一定的差异.通过综合比较和分析2种方法的优化体系扩增出的条带数、多态性条带数及多态性比率.最终建立了结缕草属植物SRAP-PCR的最佳反应体系:Mg2+2.00 mmol/L、dNTP 220μmol/L、引物0.20μmol/L、Taq DNA聚合酶0.50 U、模板DNA 60 ng、2μL 10×buffer,总体积为20μL.这一优化体系的建立为今后利用SRAP标记技术进行结缕草属植物遗传多样性、种质鉴定、遗传连锁图谱及亲缘关系分析等方面的研究提供了科学的依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭海林	江苏省中国科学院植物研究所	29	814	17.0	28.0
2	刘建秀	江苏省中国科学院植物研究所	79	2095	26.0	43.0
3	陈宣	江苏省中国科学院植物研究所	6	170	6.0	6.0
4	薛丹丹	南京农业大学园艺学院	6	170	6.0	6.0
6	王志勇	江苏省中国科学院植物研究所	10	93	5.0	9.0
7	郑轶琦	江苏省中国科学院植物研究所	6	138	6.0	6.0