猪CAPN1基因部分外显子及3'UTR区的SNPs检测

• 作者: 关庆芝 刘娣 刘慧 杨秀芹 许尧 郭丽娟
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 CAPN1基因 瘦肉率 嫩度 PCR-SSCP PCR-RFLP
• 年，卷（期）: 2008,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 741-746
• 页数: 6页
• 分类号: S8
• 字数: 4200字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0253-9772.2008.06.013

摘要

以野猪.民猪和大白猪为研究对象,根据网上公布的序列设计了7对引物,采用测序,PCR-SSCP和PCR-RFLP方法对CAPN1基因的部分外显子和3'UTR区进行了单核苷酸多态性检测和基因型分析,探讨CAPN1基因多态性与瘦肉率和嫩度的关系.研究发现11个SNPs,其中5个位于外显子,4个位于内含子,2个位于3'UTR区,外显子中的突变有一处是错义突变,导致了蛋白质多肽链第260位氨基酸发生了M/V的替代.群体遗传学分析表明,在所检测的各多态位点上,野猪、民猪、大白猪3个品种间不同基因型的分布都存在着极显著的差异(P<0.01),而野猪和民猪之间各基因型的分布差异不显著(P>0.05),民猪和大白猪之间各基因型的分布存在着极显著的差异(P<0.01).结合品种特性分析表明,P4、P6引物和3'UTR区Hinf1位点所检测的不同基因型和瘦肉率具有一定的相关性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘娣	东北农业大学动物科技学院	135	846	16.0	21.0
3	杨秀芹	东北农业大学动物科技学院	60	300	9.0	14.0
4	许尧	东北农业大学动物科技学院	5	29	3.0	5.0
7	刘慧	东北农业大学动物科技学院	47	344	8.0	17.0
8	郭丽娟	东北农业大学动物科技学院	8	38	4.0	6.0
9	关庆芝	东北农业大学动物科技学院	10	47	5.0	6.0