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超级杂交水稻TIR1类似基因cDNA的克隆与生物信息学分析
超级杂交水稻TIR1类似基因cDNA的克隆与生物信息学分析
作者:
王若仲
胡皝
萧浪涛
赵玄之
黄志刚
原文服务方:
植物学报
生长素受体
生物信息学
超级杂交水稻
TIR1
摘要:
生长素受体TIR1通过形成SCFTIR1复合体与生长素直接结合,即为Aux/AA在26S蛋白酶体降解过程中的关键蛋白质.在Blast检索和生物信息学分析的基础上设计特异引物,以超级杂交水稻(Oryza sativa)亲本株1S为材料,通过RT-PCR扩增并经T-A克隆后测序,获得一条长度为2 219 bp的序列,其开放阅读框长度为1 764 bp,编码含587个氨基酸残基的肽链.该序列经生物信息学分析发现,其与拟南芥TIR1相似性为77%,同样具有2个保守的结构域,即F-box和亮氨酸富集重复Ⅸ域(LRR),且都不具有跨膜结构域和信号肽.该cDNA序列命名为OsTIR1.
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文献信息
篇名
超级杂交水稻TIR1类似基因cDNA的克隆与生物信息学分析
来源期刊
植物学报
学科
关键词
生长素受体
生物信息学
超级杂交水稻
TIR1
年,卷(期)
2008,(6)
所属期刊栏目
实验简报
研究方向
页码范围
695-700
页数
6页
分类号
S5
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-3466.2008.06.009
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
萧浪涛
湖南农业大学植物激素与生长发育湖南省重点实验室
149
3448
31.0
53.0
2
黄志刚
湖南农业大学植物激素与生长发育湖南省重点实验室
33
132
5.0
10.0
3
王若仲
湖南农业大学植物激素与生长发育湖南省重点实验室
51
672
14.0
25.0
4
赵玄之
湖南农业大学植物激素与生长发育湖南省重点实验室
3
10
2.0
3.0
5
胡皝
湖南农业大学植物激素与生长发育湖南省重点实验室
3
64
2.0
3.0
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生物信息学
超级杂交水稻
TIR1
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
植物学报
主办单位:
中国科学院植物研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1674-3466
CN:
11-5705/Q
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1983-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
2216
总下载数(次)
0
总被引数(次)
59923
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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