GenBank中CDS..join特征域研究初步

• 作者: 金鹰
• 来源期刊: 华南师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: GenBank 编码序列 外显子 内含子 EID
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 页码范围: 95-99
• 页数: 5页
• 分类号: Q34
• 字数: 2359字
• 语种: 中文

摘要

由NCBI建立和维护的大型公用数据库GenBank是进行生物学研究最为重要的工具之一. 其DNA序列数据库的每条记录描述了相关基因的详细特征,其中的CDS(Coding Sequence)特征域被认为是DNA生成蛋白质的翻译指令,它对GenBank中每条基因的组装进行了详细的说明. 通过CDS可以很容易在互联网上进行多序列搜索,并获得相关的基因序列、编码蛋白序列及种属特异性信息. 利用CDS特征域构建外显子-内含子数据库(Exon-Intron Database,EID)是研究内含子起源、进化和功能的重要手段,本文试图以CDS为线索,解决建库初期从GenBank海量数据中提取相关序列的问题.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	金鹰	华南师范大学光子中医实验室	22	146	6.0	11.0