40株新城疫病毒全基因组的比较研究

• 作者: 刘文博 刘秀梵 曹永忠 顾敏
• 来源期刊: 扬州大学学报（农业与生命科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 新城疫病毒 全基因组 生物信息学 比较
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 页码范围: 1-5
• 页数: 5页
• 分类号: S852.65+9.5
• 字数: 2546字
• 语种: 中文

摘要

利用作者单位测得的和从GenBank检索得到的40株新城疫病毒(NDV)全基因组序列,采用SMS、DNAStar等生物信息分析软件,比较分析NDV全基因组的基本特征和分子进化规律.结果表明: 40株NDV全基因组核酸序列长度有3种:15186、15192、15198 nt,均符合6倍数规律;基因组A+T含量占53%～54%,C+G含量占46%左右;NDV基因组前三分之一(4500 nt前)序列存在高GC含量区,特别是在大约1200～2400 nt区域,GC含量最高达到69%;F基因片段构建的分子进化树显示,40株NDV划分为两大类(ClassⅠ,ClassⅡ),基因组长度为15198 nt的毒株属于ClassⅠ,其余的属于ClassⅡ;ClassⅡ毒株又分为基因Ⅰ～Ⅶ型,这些已测序的毒株中没有基因Ⅷ和Ⅸ型;病毒6个基因CDS序列构建的进化树显示,各基因进化基本保持一致,仅少数毒株存在差异,可能与病毒分子的基因重组有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘秀梵	扬州大学农业部畜禽传染病学重点开放实验室	373	3732	28.0	39.0
2	刘文博	扬州大学农业部畜禽传染病学重点开放实验室	67	568	14.0	21.0
3	曹永忠	扬州大学农业部畜禽传染病学重点开放实验室	39	133	7.0	9.0
4	顾敏	扬州大学农业部畜禽传染病学重点开放实验室	25	80	6.0	8.0