利用阵列分析水稻AP2/EREBP家族基因的表达特性

• 作者: 王台 胡一兵 赵利锋
• 来源期刊: 植物学报
• 关键词: AP2/EREBP 杂交分析 水稻 预测基因
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 27-33
• 页数: 7页
• 分类号: Q94
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-3466.2008.01.004

摘要

AP2/EREBP蛋白是广泛存在于高等植物中的且包含AP2/EREBP 功能域的重要转录因子家族,通常可分为包含单功能域的EREBP类蛋白和包含两个功能域的 AP2类蛋白,它们的功能涉及植物生长发育调控和对逆境应答等许多方面.据预测,水稻基因组编码150个左右的AP2/EREBP 家族成员,但目前绝大多数蛋白的功能仍不清楚.为了解这些基因在水稻不同器官中的表达特性,我们以AP2/EREBP功能域的氨基酸序列为基础,从水稻基因组数据库中搜索到12个AP2类以及20个EREBP类预测基因 ,利用PCR扩增的编码区序列制备了这些预测基因的macro-array . 以幼芽、幼根、幼叶、颖花和灌浆期成熟叶的 cDNA为探针,杂交分析结果显示: 不同AP2类预测基因之间的表达量差别较大,但同一个基因在不同器官中表达量基本一致; 与此不同的是,大部分EREBP类预测基因在幼根和成熟叶片中表达量较高,而在幼芽和幼叶中表达量较低.这些预测基因的表达模式可能与它们的功能密切相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王台	中国科学院植物研究所	31	504	14.0	21.0
2	赵利锋	中国科学院植物研究所	2	52	1.0	2.0
6	胡一兵	中国科学院植物研究所	3	66	1.0	3.0