致病疫霉菌无毒基因AVR3a的克隆与序列分析

• 作者: 兰成忠 李本金 汪进仕 翁启勇 胡方平 赵健 邱荣洲 陈庆河
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 马铃薯 致病疫霉菌 无毒基因AVR3a 毒性 基因克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2008,（3）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 235-238
• 页数: 4页
• 分类号: S435.32
• 字数: 3107字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0384.2008.03.003

摘要

根据GenBank中致病疫霉菌无毒基因AVR3a序列(AJ893357)及参考文献中的特异引物(Pex147F,Pex147R),以致病疫霉菌基因组DNA为模板进行PCR扩增,得到了特异性扩增片段,并对特异片段进行纯化和测序.结果表明,该片段的长度为451 bp,经序列分析表明,其氨基酸编码序列为441 bp,共编码147个氨基酸.BLAST分析结果显示,该片段核苷酸序列与无毒基因AVR3a核苷酸序列的同源性为99.34%,氨基酸序列比对结果表明,氨基酸序列在第19、80和103位存在着差异,这些核苷酸序列差异以及某些关键氨基酸的改变有可能是导致不同菌株中AVR3a毒性变异的原因.