口蹄疫病毒株AF72 VP1的结构构建与B细胞表位预测

• 作者: 刘力宽 吕建亮 张中旺 张昱 张永光 张淑刚 方玉珍 李正丰 杜进鑫 潘丽 王永录 蒋守田
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 医学
• 关键词: 口蹄疫病毒 VP1结构蛋白 3D结构 B细胞表位
• 年，卷（期）: 2008,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 158-163
• 页数: 6页
• 分类号: R5
• 字数: 3467字
• 语种: 中文

摘要

以口蹄疫病毒株AF72 RNA为模板,反转录并扩增目的基因,PCR纯化产物与pGEM-T easy载体连接并转化JM109菌株,用凝胶电泳、PCR和EcoR I酶切法鉴定为阳性的重组质粒进行测序.比对测序结果确定AF72 VP1的核苷酸序列,利用同源建模的方法建立AF72 VP1结构蛋白的3D结构,在此基础上,综合亲水性、可塑性、抗原指数以及表面可能性等参数预测AF72 VP1结构蛋白的B细胞抗原表位.结果显示,VP1结构蛋白呈现较规则的空间构象,其中5～11、24～30、43～47、82～87、132～147和196～203氨基酸区段是AF72 VP1结构蛋白可能的B细胞抗原表位区域,该结果将为进一步的FMDV多表位疫苗研究提供很有价值的参考信息.