利用核糖体DNA限制性酶切谱(ARDRA)分子技术和小亚基单位核糖体RNA(SSrRNA)基因序列分析对五种双眉虫(原生动物,纤毛门,游仆目)种内及种间关系的探讨

• 作者: 伊珍珍 宋微波 张倩倩 朱明壮 王艳刚 陈子桂 马洪钢
• 来源期刊: 动物分类学报
• 学科: 生物学
• 关键词: ARDRA 双眉虫属 拟双眉虫属 类双眉虫属 种间区分 小亚基单位核糖体RNA基因 系统关系
• 年，卷（期）: 2008,（3）
• 页码范围: 542-548
• 页数: 7页
• 分类号: Q956
• 字数: 3602字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-0739.2008.03.024

摘要

从12种限制性内切酶中筛选出6种可获得种问多样性的内切酶:Alu Ⅰ,TaqⅠ.HaeⅢ,Hinf Ⅰ,MspⅠ,Xba Ⅰ,对广义双眉虫Diophrys-complex5个种(伪寡毛双眉虫Diophrys apoligothrix、悬游双眉虫D.appendiculata、盾圆双眉虫D.scutum、秀丽拟双眉虫Paradiophrys irmgard、针毛类舣眉虫Diophryopsis hystrix)共7个种群的核糖体基因(18S小亚基、部分23S大业基及其内转录间隔区域)进行多位点酶切.结果显示,种间差异明显大于种内差异.利用RAPDistance 1.04软件构建的邻接树表明,盾圆双眉虫的3个种群表现出高度的同源性;3个近缘属(双屑虫属、拟双眉虫属、类双眉虫属)可以被明确区分,并支持类双眉虫属与拟双眉虫属的独立性.从GenBank/EMBL数据库中获得广义双眉虫及相近种的小亚基单位核糖体RNA(SSrRNA)基因序列,利用邻接法(NI),贝叶斯法(BaLyesian)和最大简约法(MP)构建的系统发生树具有基本一致的拓扑结构.结果显示:狭义双眉虫属Diophrys为单源发生系,并与类双眉虫属Diophryopsis组成姐妹群;尽管拟双眉虫属Paradiophrys具有广义双眉虫典型的形态学特征,但与尾刺虫属Uronychia 有着较近的亲缘关系.本工作同时表明,核糖体DNA限制性酶切(ARDRA)技术可靠地区分纤毛虫的形态相似种,并在双眉虫属间水平的系统关系推定中存在一定的适用性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宋微波	中国海洋大学原生动物学研究室	37	411	13.0	18.0
2	马洪钢	中国海洋大学原生动物学研究室	11	40	3.0	6.0
3	朱明壮	中国海洋大学原生动物学研究室	10	79	4.0	8.0
4	伊珍珍	中国海洋大学原生动物学研究室	3	9	2.0	3.0
5	陈子桂	中国海洋大学原生动物学研究室	4	20	2.0	4.0
6	张倩倩	中国海洋大学原生动物学研究室	5	19	3.0	4.0
7	王艳刚	中国海洋大学原生动物学研究室	2	5	2.0	2.0