三疣梭子蟹基因组微卫星特征分析

• 作者: 刘振辉 刘萍 宋来鹏 李健
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 三疣梭子蟹 基因组 微卫星
• 年，卷（期）: 2008,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 738-744
• 页数: 7页
• 分类号: Q959.223
• 字数: 5429字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-8737.2008.05.004

摘要

对三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)部分基因组DNA文库测序,获得了总长度为622409个碱基的基因组DNA序列,从中找到微卫星重复序列(1～6bp重复)697个.统计微卫星重复类型,以两碱基重复数目最多,为445个,占微卫星序列总数目的63.84%;其次是三碱基重复152个,占21.81%;再次分别是单碱基重复45个,占6.46%;四碱基重复31个,占4.45%;五碱基重复14个,占2.01%;六碱基重复1个,占1.43%.在单碱基重复类型中,重复拷贝类别全部为A:两碱基重复类型中,AG重复数目最多,其次是AC和AT;三碱基重复类型中以ACT最多,其次是AGG和AAT;四碱基重复类型中,AGAC重复数目最多;五碱基重复类型中,以AACCT重复拷贝类别最多;六碱基重复中以AGGGGA重复数目最多.GC重复拷贝类别的重复数目很少,只发现1个(GenBank注册号为EU113241).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘萍	中国水产科学研究院黄海水产研究所	124	3043	33.0	48.0
2	李健	中国水产科学研究院黄海水产研究所	215	3950	34.0	49.0
3	宋来鹏	中国水产科学研究院黄海水产研究所	3	51	3.0	3.0
7	刘振辉	中国海洋大学海洋生命学院	11	135	6.0	11.0