微卫星标记对WHBE兔封闭群、日本大耳白兔和新西兰兔的遗传分析

• 作者: 余佳 应华忠 徐孝平 朱亮 王德军 肖慧 蔡月琴 陈民利 陶涛
• 来源期刊: 中国比较医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: WHBE兔封闭群 日本大耳白兔 新西兰兔 微卫星DNA 多态性
• 年，卷（期）: 2008,（9）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 21-27
• 页数: 7页
• 分类号: R394
• 字数: 3959字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-7856.2008.09.005

摘要

目的 分析比较大耳白黑眼兔(WHBE兔)封闭群与日本大耳白兔(JW兔)、新西兰兔(NZW兔)基因组存在的微卫星结构,研究WHBE兔封闭群的微卫星多态性.方法 利用21个微卫星位点,通过微卫星分子标记技术对WHBE兔封闭群、JW兔和NZW兔进行遗传多样性检测和对比.结果 根据初步结果,在21对微卫星引物中筛选出扩增产物稳定并且具有多态性的11对引物.WHBE兔封闭群在每个位点上的等位基因数为3-8个不等,11个位点的平均有效等位基因数为2.0402个,平均杂合度为O.4810;JW兔在每个位点上的等位基因数为2-8个不等,11个位点的平均有效等位基因数为3.6077个,平均杂合度为0.5039;NZW兔在每个位点上的等位基因数为3-9个不等,11个位点的平均有效等位基因数为2.6537个,平均杂合度为0.5334.WHBE兔封闭群在11个微卫星位点上的平均多态信息含量(PIC)为0.6005,多位点累积个体识别率达到100%,多位点累积非父排除概率(CPE)在双亲信息都是未知情况下的为0.9613,而在得知任-亲本信息的情况下,CPE值高达0.9973.在11个微卫星座位中,9个位点上出现了WHBE兔封闭群特有等位基因,其中在Sat2、Sat5、Sat7/、Sat12、Sat13、Sat16、S0144和INRACCDDV0003八个位点上WHBE兔封闭群的特有等位基因为一个,在Sat8位点上为两个.结论 WHBE兔8个位点的平均杂合度、平均有效等位基因数均比JW兔及NZW兔低,说明WHBE兔群体的基因纯合度高于其他两个品系,具有更优的遗传稳定性.9个WHBE兔特有的等位基因可作为区分WHBE兔封闭群和其它两个品系实验兔的分子标记.