橡胶树EST-SSRs发掘研究

• 作者: 华玉伟 卢轶 曾霞 胡彦师 黄华孙 龙青姨
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 橡胶树 分子标记 Esrr-SSRs
• 年，卷（期）: 2008,（5）
• 所属期刊栏目: 作物营养、栽培与遗传育种
• 页码范围: 583-588
• 页数: 6页
• 分类号: S794.1
• 字数: 3916字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2008.05.010

摘要

随着橡胶树大量ESTs序列的产生,为EST-SSRs发掘提供了丰富的公共序列资源.本研究首先将11 809条橡胶树ESTs组装成3 932条非冗余序列,其中323条ESTs检索到SSRs 358个,SSRs出现的频率为9.1%.SSR重复单元共93种.其中二核苷酸重复(57.5%)、三核苷酸重复(26.0%)和六核苷酸重复(12.8%)占所有重复单元的96.3%.对323条SSR-ESTs进行特异扩增弓l物设计,共获得158对引物,对48份包括31份魏可汉种质、12份1981'野生种质、2份色宝橡胶、2份光亮橡胶和l份少花橡胶扩增,其中60对引物扩增出l条预期长度DNA片段,占所有设计引物的38%,并筛选到40对具有多态性的引物.EST-SSRs标记的发掘为巴西橡胶树分子辅助育种、种质资源功能遗传多样性分析等研究提供了良好的标记.