家马核基因组中线粒体核内插入序列分析

• 作者: 任建峰 何帆 刘斌 姜枫 申欣 苗永旺
• 来源期刊: 动物学研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 线粒体DNA 核内插入序列 Numt 家马 假基因
• 年，卷（期）: 2008,（6）
• 所属期刊栏目: 分子生物学与进化
• 页码范围: 577-584
• 页数: 8页
• 分类号: Q349.5|Q959.843
• 字数: 4738字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1141.2008.06577

摘要

在各种真核生物核基因组中,存在一些由线粒体基因组转移进入核基因组中的DNA片段,这些被认为是分子化石的片段叫做线粒体核内插入序列(Numt).由于Numt与真实的线粒体序列高度相似,因此它的存在必然会成为PCR扩增线粒体DNA的不利因素.利用已经公布的家马(Equus caballus)基因组序列(2007年9月公布,GenBank登录号为NC 009144--NC 009175)对家马Numt进行了深入分析,其发现200个可能的Numt,长度范围为29到3727bp,其中有10个的长度大于800bp.分析结果显示由于不存在线粒体控制区域的疑似Numt,因此对基于此区域的群体遗传学研究不会产生影响.本研究还发现在家马进化过程中,第1号和27号染色体更倾向于接受线粒体序列的转移.以上结果将为今后马科动物的研究提供重要的参考信息,有助于避免在线粒体DNA研究中由于Numt污染的存在而得出错误的实验结果.