我国五大淡水湖日本沼虾线粒体COI基因部分片段序列比较

• 作者: CHENG Xi FENG Jian-bin 孙悦娜 李家乐
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 日本沼虾 细胞色素氧化酶亚基I 遗传多样性 中国五大淡水湖
• 年，卷（期）: 2008,（4）
• 页码范围: 517-525
• 页数: 9页
• 分类号: Q785|S917
• 字数: 5354字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-0615.2008.04.003

摘要

对我国五大淡水湖日本沼虾100个野生个体的线粒体细胞色素氧化酶亚基I(COI)部分序列进行了测定和分析,经比对获得578 bp核苷酸片段,发现49个变异位点,得到35个单倍型,包括7个共享单倍型,各群体都具有较好的单倍型多态性和核苷酸多态性,其中鄱阳湖群体遗传多样性相对最高.AMOVA分析表明,五群体间总遗传分化系数Fst=0.3187(P<0.05),群体间具有较高的遗传分化.MEGA3.1软件计算五群体的Kimura 2-paramter遗传距离,洞庭湖群体和巢湖群体之间的遗传距离最远为0.0191,巢湖群体和洪泽湖群体之间的遗传距离最近为0.0051.以同属胖掌沼虾(Macrobrachium inflatum)为外群分别构建了NJ和UPGMA系统树,结果显示洞庭湖和鄱阳湖为一族群,太湖、巢湖和洪泽湖为一族群.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	FENG Jian-bin	上海海洋大学省部共建水产种质资源创新与利用重点实验室	1	57	1.0	1.0
2	CHENG Xi	上海海洋大学省部共建水产种质资源创新与利用重点实验室	1	57	1.0	1.0