锯缘青蟹(Scylla serrata) Hsp70基因cDNA的克隆及序列分析

• 作者: 孔义军 袁嘉恩 许忠能 谢数涛 雷腊梅 韩博平
• 来源期刊: 生态科学
• 学科: 生物学
• 关键词: Hsp70基因 RACE RT-PCR 锯缘青蟹
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 24-30
• 页数: 7页
• 分类号: Q915.819+.6
• 字数: 5055字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-8873.2008.01.005

摘要

采用RT-PCR及RACE技术克隆锯缘青蟹(Scylla serrata)的热休克蛋白Hsp70基因并进行序列分析.克隆测序后拼接得到一条长2482bp的cDNA序列,该序列ORF (Open reading frame,开放阅读框)为1950bp,编码649个氨基酸,分子量约为71.06kD,理论等电点为5.24.3'UTR (untranslated region,非编码区)为158bp,5'UTR为40bp.通过antheprot分析发现2个Hsp70家族的签名序列:IFDLGGGTFDVSIL, IVLVGGSTRIPKIQK; Dnak特征基序DLGTT-S-V;非细胞器基序:RARFEEL;核定位信号标签:KKDPSESKRALRRL;胞质Hsp70特征基序EEVD.同源性分析表明,锯缘青蟹Hsp70编码区核苷酸序列与凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)、斑节对虾(Penaeus monodon)、罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)的相似性分别为84.02%、83.87%和79.60%;核苷酸序列所推导出的Hsp70氨基酸序列,与凡纳滨对虾、斑节对虾和罗氏沼虾的相似性分别为92.79%、92.17%和96.47%.本研究克隆了锯缘青蟹Hsp70基因,为进一步深入研究锯缘青蟹的抗逆机理及其遗传改良奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韩博平	暨南大学水生生物研究所	192	4189	32.0	56.0
2	雷腊梅	暨南大学水生生物研究所	54	647	15.0	23.0
3	许忠能	暨南大学水生生物研究所	70	1391	22.0	35.0
4	谢数涛	暨南大学水生生物研究所	33	328	10.0	16.0
5	袁嘉恩	暨南大学水生生物研究所	4	19	3.0	4.0
6	孔义军	暨南大学水生生物研究所	2	18	2.0	2.0