盐胁迫下西伯利亚蓼6个时期混合叶cDNA文库的构建和初步分析

• 作者: 刘关君 刘明坤 朱翔 杨传平 许志茹 阎秀峰
• 来源期刊: 植物生理学通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 西伯利亚蓼 混合叶 cDNA文库
• 年，卷（期）: 2008,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1099-1105
• 页数: 7页
• 分类号: Q94
• 字数: 5189字
• 语种: 中文

摘要

以3%NaHCO3胁迫处理西伯利亚蓼2h、6h、12h、1d、2d和3d共6个时期混合叶为材料,提取总RNA.根据Stratagene公司cDNA建库试剂盒构建了西伯利蓼混合叶cDNA文库.原始丈库滴度为2.0×106 pfu·mL-1,扩增后丈库滴度为4.5×109 pfu·mL-1,重组率为95.9%,插入片段大小在0.3～1.5 kb之间,平均长度为0.45 kb左右.经测序获得2575个EST序列,拼接出1977个假定独立转录本(TUTs),其中文库中含有大量低丰度表达基因,约占TUTS总数的89.58%.BlastX分析表明,1 977个TUTs中共有720个TUTS有明确功能注释,其中参与胁迫过程中代谢、能量、光合作用和蛋白合成基因表达量较高,而涉及转录、信号转导、细胞防御和救援基因表达量较低.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨传平	东北林业大学林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室	231	4191	35.0	51.0
2	阎秀峰	东北林业大学林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室	150	4808	37.0	64.0
3	许志茹	东北林业大学林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室	44	355	10.0	18.0
4	刘关君	东北林业大学林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室	53	527	12.0	22.0
5	朱翔	东北林业大学林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室	3	88	2.0	3.0
6	刘明坤	东北林业大学林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室	11	30	4.0	5.0