银鲳皮肤和肌肉组织的基因表达谱分析

• 作者: 徐善良 杨桂梅 杨琳琳 蒋燕 许柳雄 陈新军 鲍宝龙
• 来源期刊: 上海水产大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 银鲳 基因表达谱 皮肤 肌肉 表达序列标签
• 年，卷（期）: 2008,（4）
• 页码范围: 390-395
• 页数: 6页
• 分类号: S917
• 字数: 2002字
• 语种: 中文

摘要

采用目前国际上最为通用的cDNA文库构建方法,构建了银鲳皮肤和肌肉组织的cDNA文库,通过一定规模的序列测定,并借助生物信息学技术,分析了164个序列,得到了105个不同的基因(或表达序列标签),在105个不同的基因中,68.6%基因没有冗余,1倍、2倍、3倍和4倍冗余的分别占23.8%,3.8%, 2.8%和1%.皮肤和肌肉组织表达基因的组成中,除了21个没有同源序列的未知基因外,可初步归为代谢相关的酶(38个)、DNA有关的酶(7个)、结构蛋白(4个)、膜蛋白(13个)、线粒体蛋白(1个)、转录因子(9个)、信号传导相关的蛋白(10个)和未知蛋白(2个)等8大类,其中,转录因子、膜蛋白,和DNA有关的酶的基因冗余程度相对较高.这些研究结果,为积累银鲳遗传方面的基础信息,了解银鲳皮肤和肌肉组织的基因表达提供了较好的研究基础.