斯氏假单胞菌Pseudomonas stutzeri A1501氧胁迫下基因表达谱研究

• 作者: 平淑珍 张维 林敏 燕永亮 王忆平 窦岳坦 金奇 陆伟 陈明
• 来源期刊: 科学通报
• 关键词: 斯氏假单胞菌 Pseudomonas stutzeri A1501 全基因组芯片 氧胁迫 联合固氮 氧化还原酶
• 年，卷（期）: 2008,（6）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 664-671
• 页数: 8页
• 语种: 中文

摘要

斯氏假单胞菌Pseudomonas stutzeri A1501分离自我国南方水稻田,在低铵和微好氧条件下能紧密结合在水稻根表,并侵入根内生长和固氮.为探讨氧对A1501基因组表达的影响,利用全基因组芯片技术,研究不同氧浓度(0.5%,21%)下A1501基因组表达谱,结果表明:(i)67个基因在高氧浓度下表达上调2倍以上,其中17个基因的功能未知;(ii)68个基因在高氧条件下表达,其中约50%的基因参与固氮或反硝化.实时定量RT-PCR验证结果表明,4个编码氧化还原酶的基因和7个编码胞外夹膜多糖和抗原寡糖合成的基因在高氧下表达上调,其中sodC在高氧下表达上调2.7倍、编码黄素单胺氧化酶相关蛋白的基因PST1610表达上调2.2倍、编码α-酮戊二酸-铁氧化酶族氧化还原酶的基因PST3584表达上调3.2倍、编码NAD依赖型氧化还原酶的基因PST2179表达上调2.9倍.这些基因及其表达产物可能在A1501氧保护机制中发挥作用.