日本七鳃鳗(Lampetra japonica)Lyb基因的克隆与分析

• 作者: 张玮玮 金萍 马飞 黄惠芳
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 农学
• 关键词: 日本七鳃鳗 Y-box基因 cDNA末端快速扩增(RACE) 序列分析 系统发育分析
• 年，卷（期）: 2008,（12）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1597-1602
• 页数: 6页
• 分类号: S9
• 字数: 4449字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2008.01597

摘要

采用RT-PCR和RACE技术,从日本七鳃鳗(Lampetra japonica)口腔腺、肝脏中分离获得了3条Y-box基因序列,分别命名为Lyb1.Lyb2和Lyb3,生物信息学分析其编码的蛋白质序列长度分别为331、181和171个氨基酸残基.采用DNAMAN软件,将七鳃鳗的3个Y-box蛋白氨基酸序列与海鞘、斑马鱼、清鳉、河豚鱼和小鼠Y-box蛋白进行同源性分析,结果显示他们共有一个保守的冷休克结构域,其中包含两个RNA结合基序RNP-1和RNP-2,表明获得的Lyb基因属于Y-box基因家族成员.此外,从Swiss-Prot下载了经实验验证过的Y-box蛋白序列数据,结合实验克隆得到的Lyb基因所编码的氨基酸序列构建系统发育树,发现Y-box基因在有颌类出现以前只有一种类型,有颌类出现以后,Y-box基因分化成YB1、YB2和CSDA三种类型.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张玮玮		7	26	3.0	4.0
2	马飞	辽宁师范大学海洋生物功能基因与蛋白质组学研究所	12	118	7.0	10.0
3	金萍	辽宁师范大学海洋生物功能基因与蛋白质组学研究所	2	5	1.0	2.0
4	黄惠芳	辽宁师范大学海洋生物功能基因与蛋白质组学研究所	6	35	3.0	5.0