遗传距离与利用微卫星进行系统树构建初探

• 作者: HENNER Simianer 孙伟 宋光明 常国斌 常洪 张柳 杨章平 毛永江 许明
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 系统树构建 微卫星 遗传距离
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 129-135
• 页数: 7页
• 分类号: S823.2
• 字数: 4665字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0366-6964.2008.02.001

摘要

以中国牛亚科家畜6个群体12对微卫星数据为基础,采用6种遗传距离(DA、DC、DS、Dsw,(σμ)2和DTL)和2种聚类方法(UPGMA和NJ法),探索它们对系统树构建准确性的影响.结果表明:微卫星位点平均杂合度水平显著影响系统树构建的准确性,用DA和DC遗传距离构建的系统树准确性相对较高,但很难确定NJ法和UPGMA法哪一种更适合于系统树的构建,而DTL遗传距离用于系统树构建有待进一步完善;最后,对微卫星用于家畜系统树构建的有效性和局限性进行了探讨.