常规PCR、实时定量PCR检测传染性皮下及造血器官坏死病毒的效果分析

• 作者: 刘荭 周优 孙敏 岳志芹 徐彪 朱来华 梁成珠 汪东风 高宏伟
• 来源期刊: 海洋水产研究
• 学科: 农学
• 关键词: 凡纳滨对虾 传染性皮下及造血器官坏死病毒(IHHNV) 实时定量PCR 常规PCR 测序
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 90-96
• 页数: 7页
• 分类号: S945.4
• 字数: 3048字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-7075.2008.02.014

摘要

对虾传染性皮下及造血器官坏死病毒(IHHNV)可感染世界各地养殖对虾,给对虾养殖业造成严重经济损失.本实验首次采用实时定量PCR法对广西地区的84份凡纳滨对虾样品进行检测,同时以常规PCR检测作对照.实时定量PCR检测阳性率为79.8%,常规PCR检测阳性率为40.5%,表明广西地区养殖的凡纳滨对虾IHHNV的感染率较高.将二者检测均呈阳性的30份样品扩增产物进行序列分析测序,测序结果通过DNA STAR软件包进行分析,并通过NCBI Blast与GenBank中的序列进行比对.结果证明,测定的是IHHNV序列.30份样品的IHHNV序列很保守,可以分为4种类型,仅有两个碱基的位置发生变异.实时定量PCR检测IHHNV,快速、灵敏、准确,特异性好,可以作为检测对虾感染病毒的有效方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	汪东风		154	1823	23.0	33.0
2	梁成珠		84	406	10.0	15.0
3	徐彪		32	150	7.0	11.0
4	高宏伟		29	188	8.0	12.0
5	孙敏		18	118	6.0	10.0
6	岳志芹		54	250	9.0	13.0
7	刘荭		37	488	14.0	21.0
8	朱来华		28	119	8.0	9.0
9	周优		2	10	2.0	2.0