马氏珠母贝EST微卫星的筛选

• 作者: 侯占辉 洪葵 王嫣 王爱民 石耀华 郭希明 顾志峰
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 马氏珠母贝 EST-SSR 分子遗传学
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 页码范围: 174-181
• 页数: 8页
• 分类号: Q75|S968.3
• 字数: 4718字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-0615.2008.02.002

摘要

构建了马氏珠母贝的血液、足、鳃、胃、肝、心脏、外套膜、珍珠囊和感染多毛虫马氏珠母贝的血液(血感)等9个组织的cDNA文库,测序获得了6979个EST序列,从中查找到了268个重复序列,隶属于243个EST,含微卫星的EST数占EST总数的3.48%.珍珠囊cDNA文库含微卫星的序列所占比例最高,为6.16%,血感的最低,为1.65%.双碱基重复序列130个,占48.5%,(AT/AT)n类型最常见;三碱基类型的83个,占约31%,其中(AAT/ATT)n和(AAG/CTT)n较多;四碱基重复的有30个,占11.2%,(AAAT/ATTT)n占了该类型的约50%.一共能够设计151对微卫星引物,有130对可以扩增,占合成引物总数的86.09%,其中,多态性引物45对.多态性EST-SSR的筛选将为马氏珠母贝的分子遗传学研究、种质鉴定和野生资源保护等提供可靠的工具.