南海野生斑节对虾的线粒体16S rRNA基因序列单倍型分析

• 作者: 周发林 姜永杰 江世贵 黄建华
• 来源期刊: 生态学杂志
• 学科: 农学
• 关键词: mtDNA 16S rRNA 斑节对虾 单倍型
• 年，卷（期）: 2008,（11）
• 页码范围: 1955-1959
• 页数: 5页
• 分类号: S963
• 字数: 4445字
• 语种: 中文

摘要

采用聚合酶链式反应(PCR)技术对我国南海海域5个地点(三亚、深圳、阳江、湛江、北海)的野生斑节对虾100个个体的mtDNA 16S rRNA序列进行扩增,扩增产物经纯化后进行测序.用Clustal_X排序软件对所得的100个mtDNA 16S rRNA序列进行比对.通过ARLEQUIN软件对所得100个mtDNA 16S rRNA序列进行比较分析,共检测出28个变异位点,19种单倍型.19单倍型序列的碱基组成显示出较高的A+T比例(69.0%).19种单倍型序列的遗传距离在0.002～0.033.根据构建的单倍型进化关系网,5个地点群体中的单倍型呈现一种混杂的分布格局.此外,根据单倍型在5个地点群体出现的频率和单倍型进化关系网,单倍型7是最为原始的单倍型,其他18种单倍型均起源于单倍型7.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	江世贵	中国水产科学研究院南海水产研究所	100	1501	22.0	31.0
2	周发林	中国水产科学研究院南海水产研究所	46	696	17.0	24.0
4	姜永杰	中国水产科学研究院南海水产研究所	4	53	4.0	4.0
5	黄建华	中国水产科学研究院南海水产研究所	49	612	17.0	22.0