槜李等15个李品种S基因型鉴定及其多态性分析

• 作者: 吴俊 吴华清 宋宏峰 张树军 张绍铃 衡伟 黄绍西
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 李 自交不亲和性 S-Nase基因
• 年，卷（期）: 2008,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 338-342
• 页数: 5页
• 分类号: S662.3
• 字数: 4040字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-9980.2008.03.010

摘要

利用李属S-RNase基因特异性引物,对15个供试李品种进行PCR扩增,共获得30个目的条带.对这些目的条带进行测序鉴定出15个李品种的S基因型.通过与NCBI中利用BLASTn与GenBank+EMBL+DDBJ+PDB等数据库中的序列比对,结果表明,其中9个为新S-RNases基因,对9个新S-RNases核苷酸序列进行分析发现,位于高变区内的内含子大小为141～1758bp,其同源性为33.9%(S-18～S-19)～81.6%(S-20～S-21),表现出丰富的长度和序列多态性;编码区的核苷酸序列比对结果,其同源性为73.3%(S-16～S-19)～91.7%(S-17～S-22);其推导氨基酸序列相似性为67.3%(S-16～S-19)～89.1%(S-17～S-22);包含李属S-RNase一级结构所共有的C2、C3保守区和高变区(RHV).系统进化分析表明,9个新S-RNases与李属其它树种S-RNases聚类在一起,归属为李亚科(Prunoideae).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张绍铃	南京农业大学园艺学院	271	4662	36.0	50.0
2	吴华清	南京农业大学园艺学院	25	559	15.0	23.0
3	吴俊	南京农业大学园艺学院	78	1478	23.0	35.0
4	宋宏峰	江苏省农业科学院园艺研究所	55	713	15.0	25.0
5	张树军	南京农业大学园艺学院	5	93	5.0	5.0
6	衡伟	南京农业大学园艺学院	6	131	6.0	6.0
7	黄绍西	南京农业大学园艺学院	3	46	3.0	3.0