同源四倍体水稻籼型突变体Wx基因序列分析及特异识别分子标记的建立

• 作者: 刘玉花 孔繁伦 李万明 栾丽 涂升斌 王兴 肖小余 陈英 龙文波
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 农学
• 关键词: D4063-1 直链淀粉含量 Wx基因 碱基缺失 特异引物
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 209-216
• 页数: 8页
• 分类号: S5
• 字数: 5878字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0253-9772.2008.02.015

摘要

同源四倍体水稻突变株D4063-1直链淀粉含量比来源二倍体明恢63下降一半,即其直链淀粉含量为5.23%.为研究其直链淀粉含量下降的原因,根据普通水稻Wx基因设计引物,扩增测序获得了D4063-1Wx基因的全序列,并与已报道的Wx基因进行比对分析;同源四倍体水稻D4063-1Wx基因最显著变化为在外显子序列中发生碱基缺失,导致移码突变,在第9外显子终止密码子提前出现.D4063-1Wx基因碱基位点的变化还导致其序列上酶切位点的变化,对常用限制性内切酶位点分析结果表明,同源四倍体水稻相对于籼稻和粳稻多了2个sph I酶切位点,相对于粳稻减少了6个Acc I,增加了4个Xba I,1个Xho I,1个Pst I和1个Sal I酶切位点.聚类分析表明D4063-1Wx基因序列与籼稻亲源关系较近,由此推测D4063-1Wx基因来源于籼稻的Wxa基因型.另外,根据D4063-1wx基因的碱基差异,推测D4063-1Wx基因外显子碱基变化导致的RNA加工障碍是其直链淀粉降低的主要原因,并可能与其米饭较软等品质相关.本研究还根据D4063-1和籼稻、粳稻的序列差异及D4063-1在该片段上的特征序列位点设计了用于识别D4063-1的寡核苷酸片段,并作为PCR反应的引物命名为AUT4063-1,将该引物与作者设计的扩增普通籼稻、粳稻Wx基因的引物F5配合使用,建立了识别 D4063-1的显性和共显性两种检测方式的分子标记,为快速、准确鉴别低直链淀粉含量突变体D4063-1创造了条件.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	涂升斌	中国科学院成都生物研究所	20	172	10.0	12.0
2	龙文波	中国科学院成都生物研究所	10	89	7.0	9.0
3	栾丽	中国科学院成都生物研究所	13	152	9.0	12.0
4	刘玉花	中国科学院成都生物研究所	7	67	6.0	7.0
5	王兴	中国科学院成都生物研究所	15	100	7.0	9.0
6	陈英	中国科学院成都生物研究所	21	849	11.0	21.0
7	李万明		23	43	3.0	5.0
8	孔繁伦	中国科学院成都生物研究所	10	121	7.0	10.0