桑树幼叶cDNA文库的构建及部分表达序列标签分析

• 作者: 刘利 张林 戚金亮 扈冬青 方荣俊 杨永华 汪伟 沈兴家 潘一乐 潘刚 赵卫国
• 来源期刊: 蚕业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 桑树 cDNA文库 RNA转录5'末端转换 表达序列标签
• 年，卷（期）: 2008,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 581-586
• 页数: 6页
• 分类号: S888.2|Q78
• 字数: 4458字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0257-4799.2008.04.001

摘要

基于为鉴定和克隆桑树功能基因提供基础信息的目的,采用RNA转录5'末端转换(SMART)法构建了桑树幼叶全长cDNA文库.该文库容量为1.02×106 pfu/mL,重组率95%,符合构建基因文库的质量要求.从构建的桑树幼叶cDNA文库中随机挑取48个克隆进行表达序列标签(EST)测序,有效序列为32条,经UniGene数据库归并后为32条, UniGene比率为100%;与NCBI核酸数据库进行比对、查询和注释, 在32条序列中有29条序列具有同源性,其中16条为全长序列,完整性比率为55.2%;初步发现具有已知功能基因的ESTs 6个,具有推测功能基因的ESTs 5个,未命名或未知功能基因的ESTs 21个.