异育银鲫Toll样受体3的cDNA序列分析与蛋白质高级结构预测

• 作者: 冷向军 华雪铭 周洪琪 钱曦 黄旭雄
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 异育银鲫 Toll样受体3 cDNA末端快速扩增 序列分析 蛋白结构预测 生物信息学
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 页码范围: 190-199
• 页数: 10页
• 分类号: Q517|S917
• 字数: 5561字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-0615.2008.02.004

摘要

利用RT-PCR、RACE及克隆等方法获得了异育银鲫Toll样受体3(cagTLR3)基因全长cDNA序列.该cDNA全长3170 bp,5'端非编码区181 bp;3'端非编码区283 bp;开放阅读框(ORF)2706 bp,编码901个氨基酸.经序列同源性分析显示,其编码的氨基酸序列与金鱼、斑马鱼、斑点叉尾鲴、虹鳟和红鳍东方鲍有较高的相似性,其相似性分别为92%、88%、79%、75%和72%,说明TLR3在长期的进化中具有较高保守性.TLR3全长序列起始21个氨基酸残基为信号肽;50至695个氨基酸残基间包含15个富含亮氨酸的重复序列(LRR);704至726个氨基酸残基为跨膜区(TM);754至897个氨基酸残基为与白介素-1受体高度同源的区域(TIR).将异育银鲫TLR3与人和斑马鱼胞内TIR结构的氨基酸比对后发现,Phe728、Leu738、Tyr756与Arg736在TLR3的信号转导及胞内定位过程中起到关键作用.异育银鲫TLR3胞外配体结合域的三维结构呈U型,与人TLR3的相应结构十分相似,在N端具有1个二硫键,C端有2个.因LRRs上的插入序列和14个糖基化位点,异育银鲫TLR3胞外配体结合域内表面的大量β-折叠结构呈平坦的平面.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	冷向军	上海水产大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点开放实验室	47	1266	22.0	34.0
2	黄旭雄	上海水产大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点开放实验室	33	698	17.0	26.0
3	周洪琪	上海水产大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点开放实验室	78	2421	28.0	47.0
4	华雪铭	上海水产大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点开放实验室	23	1017	16.0	23.0
5	钱曦	上海水产大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点开放实验室	3	120	3.0	3.0