广西、湖南、云南三地钉螺Cytb基因序列变异和系统进化研究

• 作者: 林睿 牛安欧 胡文庆 胡缨 黎学铭
• 来源期刊: 中国病原生物学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 钉螺 Cytb基因 遗传多态性 系统进化
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 110-113
• 页数: 4页
• 分类号: R184.38
• 字数: 3912字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-5234.2008.02.008

摘要

目的 分析广西钉螺与云南、湖南钉螺Cytb基因的遗传多态性和系统进化关系.方法 收集广西靖西、云南洱源和湖南岳阳三地钉螺,提取其基因组DNA, PCR法扩增线粒体Cytb基因并测序.用Clustal W(1.82)软件对所测得的Cytb基因序列进行排序,用MEGA3.1计算其碱基组成、转换及颠换;用Kimura双参数法计算遗传距离,用非加权组平均法(UPGMA)和最大简约法(MP)构建系统发生树,同时结合三地钉螺分布和孳生地等资料进行分析.结果 PCR扩增获得Cytb基因大小为580bp.三地钉螺Cytb基因序列富含碱基A和T,A+T平均含量为61.2%,表现出较强的碱基组成偏倚.三地钉螺Cytb基因578bp的同源序列中检测到165个变异位点,约占核苷酸总数的28.5%.其中广西钉螺与湖南钉螺Cytb基因序列的变异位点为17个,约占2.94%;广西钉螺与云南钉螺Cytb基因序列的变异位点为160个,约占27.7%.广西钉螺与湖南、云南钉螺Cytb基因的遗传距离分别为0.031、0.405.采用两种方法构建的系统进化树均显示广西钉螺与湖南钉螺同属一个支系,云南钉螺单独形成另一支系.结论 广西钉螺与云南钉螺存在较大基因差异,进化速率较大,保守性较小,遗传距离较大,亲缘关系较远;广西钉螺与湖南钉螺基因差异较小,相对保守,进化速率不太大,遗传距离较小,亲缘关系较近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡缨	广西医科大学第一附属医院检验科	22	101	7.0	9.0
2	胡文庆	广西医科大学寄生虫学教研室	26	106	6.0	9.0
3	牛安欧	华中科技大学同济医学院寄生虫学教研室	35	329	12.0	17.0
4	林睿		9	43	3.0	6.0
5	黎学铭		14	64	5.0	7.0