利用基于Normal矩阵的谱平分法挖掘酵母蛋白质相互作用网络中的社团

• 作者: 王勇献 王正华 董蕴源
• 来源期刊: 激光生物学报
• 关键词: PPI网络 社团结构 谱平分法
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 13-18
• 页数: 6页
• 字数: 3906字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7146.2008.01.003

摘要

蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络是生物网络的重要组成部分,也是后基因组时代的热点研究问题.揭示PPI网络中的社团结构,对于理解其复杂相瓦作用的结构和动态特征,了解活体细胞的结构和功能都有很大作用.但目前对于PPI网络结构的分析带有很强的试探性,还没有成熟可靠的方法.传统的谱平分法需要预先知道社团的个数,为了克服这一缺点,在尤向无权的PPI网络中使用改进后的基于Normal矩阵的谱平分法,得到了55个有牛物学意义的社团.实验结果表明:尽管PPI网络中的社团结构不是很明显,基于Normal矩阵的谱平分法依然可以有效地挖掘出其中具有生物学意义的社团结构.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王正华	国防科技大学并行与分布处理国家重点实验室	72	600	12.0	20.0
2	王勇献	国防科技大学并行与分布处理国家重点实验室	26	140	7.0	11.0
3	董蕴源	国防科技大学并行与分布处理国家重点实验室	2	14	2.0	2.0