中国栽培和野生大豆农艺品质性状与SSR标记的关联分析I.群体结构及关联标记

• 作者: 刘顺湖 文自翔 王春娥 王芳 盖钧镒 赵团结 郑永战
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 栽培大豆[Glycine max(L.)Merr] 野生大豆(Glycine soja Sieb et Zucc) SSR 群体结构 关联分析
• 年，卷（期）: 2008,（7）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1169-1178
• 页数: 10页
• 语种: 中文

摘要

关联作图是一种利用连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)检测自然群体中基因位点及其等位变异的方法.利用60个SSR标记,对全国大豆地方品种群体(393份代表性材料)和野生大豆群体(196份代表性材料)的基因组变异进行扫描,分析两类群体的连锁不平衡位点、群体结构,并采用TASSEL软件的GLM(general linear model)方法对16个农艺、品质性状观测值进行标记与性状的关联分析.结果表明:(1)在公共图谱上不论共线性的或是非共线性的SSR位点组合都有一定程度的LD,说明历史上发生过连锁群间的重组;栽培群体的连锁不平衡成对位点数较野生群体多,但野生群体位点间连锁不平衡程度高,随距离的衰减慢.(2)群体SSR数据遗传结构分析发现,栽培群体和野生群体分别由9和4个亚群体组成,亚群的划分与群体地理生态类型相关联,证实地理生态类型划分有其遗传基础.(3)栽培群体中累计有27个位点与性状相关;野生大豆种质中累计有34个位点与性状相关.部分标记在两类群体中都表现与同一性状关联,检出的位点有一致性,也有互补性;一些标记同时与2个或多个性状相关联,可能是性状相关乃至一因多效的遗传基础;关联位点中累计有24位点(次)与遗传群体连锁分析定位的QTL一致.