经测序获得北极茴鱼鸭绿江亚种 Thymallus arcticus yaluensis和黑龙江茴鱼 T. grubii共26尾的线粒体:DNA控制区基因全序列,以下游黑龙江茴鱼T. tugarinae、北极茴鱼指名亚种 T. a.arcticus和欧洲茴鱼 T.thymallus作外群,构建了茴鱼属部分种分子系统发育树,以探讨北极茴鱼鸭绿江亚种分类地位的有效性.结果显示,鸭绿江茴鱼与黑龙江茴鱼的4个地理种群(呼玛河、甘河、牡丹江、松花江) 间的 Kimura 2-parameter遗传距离仅为0.007~0.015,处于黑龙江茴鱼不同地理种群问的变异范围之内(0.004~0.015),明显小于属内种间的遗传距离(0.046~0.062).以邻接法(NJ)和最大简约法(MP)构建的茴鱼属部分种系统发育树表明,鸭绿江茴鱼未构成独立的单系群,也未与北极茴鱼 T. a.arcticus形成亚种关系,而是聚到黑龙江茴鱼种群内部,共同构为一个单系群.研究表明,鸭绿江茴鱼T. a.yaluensis并非有效种,应为黑龙江茴鱼 T. grubii的同物异名,可视为黑龙江茴鱼的一个地理生态种群.