玉米Gln1-3 gDNA序列分离、基因结构、保守功能域与等位变异分析

• 作者: 吴永升 张世煌 张征 李新海 李明顺 谢传晓 郝转芳
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 玉米 Gln1-3基因 功能域 单核苷酸多态性 氮利用效率 关联性分析
• 年，卷（期）: 2008,（7）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1114-1120
• 页数: 7页
• 语种: 中文

摘要

谷氨酰胺合成酶家族是高等植物体内氨态氮同化酶,是植物体内氮利用与循环的核心构件.玉米Gln1-3基因编码叶肉细胞中的细胞质同工酶,与全株氮向籽粒蛋白质同化与氮利用效率及产量紧密相关.本研究以玉米自交系辽白371为材料,采用PCR与接头步移(walking)方法分离得到Gln1-3基因区域基因组DNA(gDNA)全长4 571 bp,起始密码子至终止密码子序列长3 062 bp.将该基因在GenBank注册,登录号为EU338535,并进行了详细注释.该基因由10个外显子、9个内含子组成,剪接方式主要为5'供位保守的GU与3'受位AG模式.编码的GS1蛋白由356个氨基酸组成,分子量39.2 kD,等电点(pI)为5.202.保守功能域分析表明,氨基末端外显子2到外显子6为氨离子结合结构域,羧基末端外显子8与外显子9构成ATP酶结构域,在胞内行使催化功能.对50个玉米自交系Gln1-3基因重要分析区域进行了等位变异分析,鉴定出364个等位变异,其中313个为SNP变异,占86%.