DNA测序信号去噪分析的一种新方法

• 作者: 汪洁 王立强 石岩 郑华 陆祖康
• 来源期刊: 光谱学与光谱分析
• 学科: 工学
• 关键词: DNA测序 荧光信号 小波分析 去噪
• 年，卷（期）: 2008,（5）
• 页码范围: 1126-1129
• 页数: 4页
• 分类号: TH74|TP391
• 字数: 2735字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3964/j.issn.1000-0593.2008.05.039

摘要

在DNA荧光测序中,噪声会影响分析的准确度和检出限.相比其他滤波方法,小波分析具有良好的时频域分辨特性.在小波去噪处理中,正确选择合适的小波基函数、去噪阈值和分解层数直接关系到信号去噪处理的质量.为了真实构建噪声模型并准确评价去噪算法的有效性,实验中通过实际系统中采集到的噪声信号叠加理想荧光信号构建DNA测序仿真信号,去噪分析的结果表明:选择sym7小波基函数、分解层数(lev=5)与使用固定格式软阈值,有效去除了DNA测序信号的噪声;处理后,信号的信噪比提高了5倍以上.将其用于处理实际的DNA电泳荧光信号,相比基于随机噪声模型的算法,去噪后的信号更加真实可靠.