代表性差异分析比较两株来自不同地区的猪源Lactobacillus菌株

• 作者: 姚文 朱伟云 苏勇
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 农学
• 关键词: Lactobacillus sobrius 代表性差异分析 猪肠道乳酸杆菌
• 年，卷（期）: 2008,（5）
• 所属期刊栏目: 分类和进化
• 页码范围: 577-582
• 页数: 6页
• 分类号: S811.6
• 字数: 3918字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0001-6209.2008.05.003

摘要

[目的]对分离自猪肠道的乳酸杆菌S1菌株进行鉴定,并比较该菌株与同种的001T菌株的基因差异.[方法]对S1菌株进行16S rRNA基因序列分析和种特异PCR检测,并且对S1菌株和Lactobacillus sobrius 001T进行代表性差异分析(Representational difference analysis,RDA).[结果]16S rRNA基因序列分析表明,与S1菌株最相似的已知菌为L.sobrius.变性梯度凝胶电泳分析显示,仔猪空、回肠细菌图谱中有一与S1菌株有相同迁移位置的优势条带,克隆、测序鉴定表明,与该条带相匹配的16S rRNA基因克隆(Clone S)的最相似已知菌也为L.sobrius.16S rRNA基因系统进化分析表明,S1菌株与Clone S和L.sobrius 16S rRNA基因序列同源性分别为99.8%和99.6%.L.sobrius特异性引物也可以扩增S1株菌的16S rRNA基因的特定片段.因此S1菌株可被确定为Lsobrius.RDA对菌株S1和同种的猪源L.sobrius 001T菌株的基因差异进行分析,未发现这两株菌的基因组差异.[结论]猪肠道乳杆酸菌S1菌株属于L.sobrius,其与猪源L sobrius 001T菌株为相似菌株.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姚文	南京农业大学消化道微生物研究室	81	1511	20.0	37.0
2	朱伟云	南京农业大学消化道微生物研究室	155	2823	28.0	45.0
3	苏勇	南京农业大学消化道微生物研究室	21	308	9.0	17.0